亚急性甲状腺炎患者的整个病期病毒感染后1～3周发病、典型者整个病期可分为早期伴甲状腺机能亢进症，中期伴甲状腺机能减退症以及恢复期三期。

　　该病早期发病多急骤，患者常出现甲状腺部位的急剧疼痛，一般从甲状腺一侧扩散至另一侧连带下颌、耳后等部位，部分患者吞咽和咀嚼时咽喉部出现不适，且伴有呈发热，伴以怕冷、寒战、疲乏无力和食欲不振等症状;该病发作至中期时血清甲状腺激素浓度可降至甲状腺机能减退水平，临床上也可转变为甲减表现;最后的恢复期阶段，以上的症状逐渐消失，甲状腺慢慢恢复至正常大小且功能正常，大多数患者可完全恢复。亚急性甲状腺炎虽分为三个阶段，但是具体症状表现因人而异，各阶段经历的时间也各不相同，且有复发的风险。