甲状腺囊肿是甲状腺的囊性肿物，属于甲状腺的病理形态学改变，而并非是一个单一的疾病。
引起甲状腺囊肿的常见疾病是：
首先是单纯性结节性甲状腺肿；
其次为甲状腺腺瘤；
少数为甲状舌管残余及第四腮裂残余；
极少数为甲状腺癌；
甲状腺囊肿根据其内容物质可分为：
胶性囊肿；
浆液性囊肿；
坏死性囊肿；
出血性囊肿；
混合性囊肿；
因此，甲状腺囊肿不同于甲状腺脓肿。后者继发于急性化脓性甲状腺炎，其内容物为脓液，临床鉴别较容易。
甲状腺囊肿患者一般无自觉症状
囊肿较大或位于甲状腺下极可出现颈部压迫症状。良性甲状腺疾病所致囊肿多表现为颈部结节性肿物，结节可柔软有囊性感，也可呈坚实结节感，表面光滑，随吞咽活动好；甲状腺癌性囊肿多为形态不规整结节，质地较硬，表面不光滑，活动受限。
甲状腺囊肿实验室检查对于确诊囊肿和判断性质有一定意义。
不管囊肿病变性质如何，同位素扫描多显示为冷结节，如囊肿处覆盖有较厚的甲状腺组织或胶质性结节囊变时，可呈现为温结节。甲状腺超声或ct等影像学检查可发现肿物所包裹的液体物质，而确诊甲状腺囊肿;如显示囊肿较大，囊壁不完整，囊壁厚而不光滑，囊内有乳头状结构，囊周围界限不清者应考虑甲状腺癌性囊肿。甲状腺穿刺囊液呈血性，反复抽吸后又迅速积聚，也提示癌性囊肿的可能，应送穿刺液找癌细胞，以明确诊断。